160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1280 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 166 aa  330  7.000000000000001e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  61.69 
 
 		 175 aa  191  3e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  57.23 
 
 		 179 aa  179  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  35.26 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  34.97 
 
 		 170 aa  80.5  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  31.33 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  34.62 
 
 		 169 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  29.3 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 		 184 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 		 168 aa  72  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  31.74 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  29.68 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  28.39 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  27.5 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  28.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  28.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  28.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  28.12 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  35.48 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.22 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  31.29 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  34.67 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  31.45 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.1 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  29.81 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  29.82 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.12 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.7 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  27.59 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  27.59 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  32.34 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  29.75 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  27.59 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  27.59 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.13 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.97 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  36.8 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  33.13 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  32.12 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  33.97 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.51 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  26.25 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  34.15 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  34.72 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.4 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  26.74 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  28.14 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  35.19 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  27.11 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  33.55 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.39 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  32.1 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.18 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.82 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  23.75 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  31.53 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.53 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  31.53 
 
 		 198 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  31.53 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  31.53 
 
 		 198 aa  53.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.43 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  35.54 
 
 		 223 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  25.45 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.33 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  26.36 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  29.46 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  35 
 
 		 214 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  29.46 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  29.46 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  29.46 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  29.46 
 
 		 195 aa  51.2  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>