220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0272 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 159 aa  325  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  74.84 
 
 		 156 aa  248  2e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  70.78 
 
 		 156 aa  231  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  53.9 
 
 		 155 aa  159  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  46.67 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  46.1 
 
 		 161 aa  124  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  40.54 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  40.4 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  39.62 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  41.22 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  37.91 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  37.84 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  41.22 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 164 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  38.16 
 
 		 159 aa  96.7  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  45.83 
 
 		 169 aa  92  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  38 
 
 		 166 aa  91.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  34.46 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.95 
 
 		 190 aa  90.9  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  37.16 
 
 		 172 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 160 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  37.58 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  39.34 
 
 		 176 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  33.78 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  32.93 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  32.93 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  33.75 
 
 		 187 aa  83.6  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  34.69 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  36.17 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  35.56 
 
 		 195 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  34.27 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  34.53 
 
 		 181 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  36.49 
 
 		 191 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.62 
 
 		 174 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  34.69 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  37.5 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 192 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  31.72 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  36.6 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  36.17 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  30.57 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  34.75 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  34.38 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  36.3 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  36.5 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  34.23 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 185 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  35.46 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  29.7 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  32.62 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.84 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.84 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  35.97 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.73 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  30.67 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.84 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  35.81 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.84 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  31.65 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.84 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  33.57 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  30.63 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  33.57 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 166 aa  73.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08520  hydrogenase maturation protease  31.54 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  36.64 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  33.78 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  32.91 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  35.25 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  34.07 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  32.05 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.68 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  31.43 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.9 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  39.34 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  25.93 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  36.23 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.67 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.86 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  32.26 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  32.26 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  31.88 
 
 		 221 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.26 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>