198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1968 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 155 aa  315  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  54.49 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  55.48 
 
 		 159 aa  179  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  55.19 
 
 		 156 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  40.94 
 
 		 165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  39.87 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  38.82 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  40.54 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  38 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  37.84 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  36.67 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  36.24 
 
 		 170 aa  103  7e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  34.9 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  37.58 
 
 		 176 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.41 
 
 		 190 aa  96.7  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  32.26 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  31.47 
 
 		 184 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  38.51 
 
 		 169 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  36.49 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  32.68 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 160 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  37.58 
 
 		 176 aa  87.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  33.83 
 
 		 181 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  29.87 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  32.35 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 		 174 aa  85.1  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 192 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 192 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 192 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  29.79 
 
 		 192 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1433  peptidase M52, hydrogenase expression/formation protein  34.88 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.50886  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  32.12 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  29.79 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  35.51 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  32.33 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  33.1 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  32.33 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  31.69 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  30.5 
 
 		 185 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  31.62 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  33.08 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  29.61 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  34.25 
 
 		 195 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  29.79 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  32.45 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  34.46 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  29.49 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  33.11 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  33.99 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  36.88 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  30.72 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  36.88 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  31.62 
 
 		 180 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  36.43 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  31.06 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  34.48 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  34.69 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  27.45 
 
 		 195 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  32.65 
 
 		 203 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  34.01 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.71 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  29.68 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.71 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.71 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.54 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.71 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.71 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  30.26 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.29 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  32.35 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.77 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  33.33 
 
 		 207 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 		 165 aa  71.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  27.66 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.38 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  33.1 
 
 		 198 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  26.95 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  31.39 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  27.34 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  31.54 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  32.58 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.82 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>