203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0269 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 168 aa  340  7e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  75.15 
 
 		 165 aa  252  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  70.7 
 
 		 165 aa  239  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  61.01 
 
 		 161 aa  206  8e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  61.01 
 
 		 165 aa  204  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  56 
 
 		 161 aa  181  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  52.23 
 
 		 170 aa  167  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.15 
 
 		 190 aa  117  9e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  42.68 
 
 		 195 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  41.29 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.61 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  37.72 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  41.22 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  37.75 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  39.74 
 
 		 169 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  40.76 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  39.49 
 
 		 201 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  40.14 
 
 		 203 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  35.98 
 
 		 221 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  41.51 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  43.26 
 
 		 209 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  39.29 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  36.91 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  38.99 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  37.2 
 
 		 208 aa  100  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  40.56 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  39.73 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  39.47 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  36.96 
 
 		 206 aa  97.4  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38 
 
 		 174 aa  97.4  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  34.87 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  34.19 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  39.44 
 
 		 222 aa  96.7  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  35.48 
 
 		 187 aa  96.7  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  41.94 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  39.42 
 
 		 195 aa  96.3  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.98 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.98 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 166 aa  95.1  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  39.13 
 
 		 176 aa  94.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  33.76 
 
 		 224 aa  94.7  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.99 
 
 		 206 aa  94.4  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  37.93 
 
 		 218 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  38.51 
 
 		 214 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  35.29 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.99 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  35.58 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  35.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  35.58 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  35.04 
 
 		 155 aa  92.8  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  37.75 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.58 
 
 		 164 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 		 185 aa  92  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  36.36 
 
 		 223 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  36.36 
 
 		 185 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  36.36 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  36.36 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  36.36 
 
 		 185 aa  91.3  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  35.8 
 
 		 191 aa  90.9  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 160 aa  90.5  9e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 165 aa  90.5  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  38.93 
 
 		 198 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  40.13 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 		 185 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  40.74 
 
 		 160 aa  90.5  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  35.07 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2091  hydrogenase expression/formation protein  33.55 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910871  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  41.48 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 		 192 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 		 192 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  32.9 
 
 		 192 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 165 aa  89  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  35.34 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  35.17 
 
 		 202 aa  88.2  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  40.85 
 
 		 144 aa  87.4  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  32.37 
 
 		 195 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  34.42 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  35.11 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  29.81 
 
 		 195 aa  87.4  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  32.37 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  32.37 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  32.26 
 
 		 192 aa  86.7  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  32.37 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  32.37 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  30.99 
 
 		 198 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  35.34 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  32.37 
 
 		 195 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.66 
 
 		 195 aa  85.9  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  30.77 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  30.99 
 
 		 198 aa  85.5  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>