220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2136 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  100 
 
 		 156 aa  319  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  74.84 
 
 		 159 aa  248  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  71.24 
 
 		 156 aa  229  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  52.86 
 
 		 155 aa  158  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  42.28 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  40 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  41.61 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  44.6 
 
 		 161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  38.82 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.12 
 
 		 190 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  36.05 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  41.09 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  37.33 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  40.14 
 
 		 165 aa  100  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  34.9 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  36 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  38.58 
 
 		 176 aa  93.6  9e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  41.32 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  37.41 
 
 		 203 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  37.74 
 
 		 195 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  43.44 
 
 		 169 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  33.61 
 
 		 164 aa  87.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  38.36 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  34.81 
 
 		 201 aa  85.1  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  33.99 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  35.04 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  36.69 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  39.84 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  35.04 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  35.04 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  37.5 
 
 		 195 aa  80.5  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  36.67 
 
 		 169 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  32.47 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  35.14 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  36.31 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  36.31 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  35.14 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  32.84 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  33.12 
 
 		 195 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  33.87 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  33.12 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  33.76 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  31.85 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  33.33 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1676  hydrogenase expression/formation protein  33.58 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  31.88 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  38.58 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  32.59 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.88 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  31.13 
 
 		 206 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  33.58 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  34.48 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.26 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  32.84 
 
 		 180 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  33.58 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  31.88 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  30.77 
 
 		 177 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  33.58 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  31.88 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  32.61 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  32.08 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  33.85 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  33.83 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  31.88 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  31.69 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1819  hydrogenase expression/formation protein  32.33 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2158  hydrogenase expression/formation protein  32.33 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.6852  normal  0.309785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1877  hydrogenase expression/formation protein  32.33 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.48 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.48 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.48 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.48 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  32.09 
 
 		 185 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.48 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  31.76 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2096  hydrogenase expression/formation protein  30.22 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  33.55 
 
 		 181 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.61 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  30.94 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  31.3 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  33.08 
 
 		 222 aa  70.5  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2407  hydrogenase expression/formation protein  31.58 
 
 		 185 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132093  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  30.83 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  35.16 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.07 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  35.66 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  33.08 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.07 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1886  hydrogenase expression/formation protein  30.83 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1919  hydrogenase expression/formation protein  30.83 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1912  hydrogenase expression/formation protein  30.83 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>