201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0162 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  53.43 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  52.02 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  53.03 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  52.82 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  53.85 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  53.85 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  53.85 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  53.85 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  53.85 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  50.51 
 
 		 222 aa  195  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  51.74 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  51.24 
 
 		 207 aa  193  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  52.02 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  49.76 
 
 		 223 aa  190  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  51.08 
 
 		 195 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  51.28 
 
 		 204 aa  184  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  49.49 
 
 		 224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  50.51 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  46.57 
 
 		 214 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  48.66 
 
 		 195 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  46.45 
 
 		 203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  53.12 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  47.54 
 
 		 209 aa  160  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  48.04 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  48.04 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  45.96 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  45.88 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  45.96 
 
 		 198 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  45.96 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  45.96 
 
 		 198 aa  154  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  48.04 
 
 		 195 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  48.04 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  48.04 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  48.04 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  48.04 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  48.04 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  47.49 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  46.84 
 
 		 198 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  45.29 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  43.12 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.12 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.12 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.12 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.12 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.12 
 
 		 164 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  42.5 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  42.5 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  42.5 
 
 		 164 aa  122  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.23 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.23 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.23 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.23 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  43.23 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  43.79 
 
 		 172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  42.86 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  42.48 
 
 		 159 aa  112  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  40.25 
 
 		 159 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  41.38 
 
 		 165 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  41.83 
 
 		 169 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  38.96 
 
 		 176 aa  108  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  39.49 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  40.13 
 
 		 161 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  41.94 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 		 157 aa  102  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  37.72 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  36.49 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  37.67 
 
 		 170 aa  100  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  39.19 
 
 		 152 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  33.94 
 
 		 161 aa  99.8  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.4 
 
 		 158 aa  99  4e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  35.4 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  35.62 
 
 		 194 aa  98.2  7e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  38.75 
 
 		 183 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  37.18 
 
 		 166 aa  94.4  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  35.37 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  36.17 
 
 		 164 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  37.97 
 
 		 167 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 160 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  39.61 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  34.29 
 
 		 157 aa  88.6  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.19 
 
 		 174 aa  88.6  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  36.76 
 
 		 165 aa  89  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  34.87 
 
 		 172 aa  86.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 170 aa  87  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  38.36 
 
 		 181 aa  85.9  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.81 
 
 		 156 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.13 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  32.7 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  32.7 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  35.92 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.3 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  33.99 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  34.18 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  33.99 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  34.39 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.85 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  32.28 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0098  hydrogenase maturation protease HydD  35.51 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0404839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>