198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0051 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
166 aa  327  6e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  40.51 
 
 
159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  42.68 
 
 
169 aa  123  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  38.51 
 
 
166 aa  121  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  36.59 
 
 
166 aa  119  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  35.06 
 
 
159 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  34.16 
 
 
221 aa  108  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  36.42 
 
 
176 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  37.84 
 
 
172 aa  107  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  34.64 
 
 
165 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.19 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.19 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.19 
 
 
164 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  41.46 
 
 
202 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  41.46 
 
 
202 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  34.59 
 
 
206 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  41.46 
 
 
202 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  41.46 
 
 
202 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  41.46 
 
 
202 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.19 
 
 
164 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.19 
 
 
164 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  36.13 
 
 
169 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.03 
 
 
172 aa  101  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  37.18 
 
 
195 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  36.2 
 
 
165 aa  101  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  34.57 
 
 
164 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.57 
 
 
164 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.57 
 
 
164 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.57 
 
 
164 aa  101  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.57 
 
 
164 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.57 
 
 
164 aa  101  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  34.57 
 
 
164 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  34.57 
 
 
164 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.57 
 
 
164 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  36.25 
 
 
218 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  35.4 
 
 
201 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  34.36 
 
 
222 aa  99  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  34.64 
 
 
214 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  41.46 
 
 
209 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  33.96 
 
 
207 aa  97.8  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  30.97 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  38.89 
 
 
195 aa  97.4  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  34.84 
 
 
223 aa  97.1  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  31.45 
 
 
224 aa  97.4  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.96 
 
 
206 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.96 
 
 
206 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  31.61 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  34.81 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  32.7 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  32.68 
 
 
168 aa  95.1  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  33.55 
 
 
165 aa  94.4  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  34.34 
 
 
208 aa  93.6  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
165 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  37.3 
 
 
198 aa  92.8  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  37.3 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  33.75 
 
 
204 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  44.35 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  37.3 
 
 
195 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  32.52 
 
 
177 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  37.3 
 
 
198 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  37.3 
 
 
198 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  37.3 
 
 
198 aa  91.7  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.79 
 
 
174 aa  91.3  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  31.41 
 
 
191 aa  91.3  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  90.5  9e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.21 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  32.9 
 
 
161 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 
195 aa  90.5  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  36.51 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  36.51 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  34.64 
 
 
208 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  36.51 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  36.51 
 
 
195 aa  89.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  36.59 
 
 
176 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  35.71 
 
 
195 aa  87  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  30.13 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  34.72 
 
 
144 aa  84.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.76 
 
 
190 aa  84  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.06 
 
 
182 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  31.48 
 
 
161 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  36.22 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  32.28 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  33.82 
 
 
194 aa  82  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 
157 aa  81.6  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  32.35 
 
 
170 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  34.81 
 
 
183 aa  80.9  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.85 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.25 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.47 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
157 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  33.13 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  32.16 
 
 
177 aa  77  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  31.82 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1900  hydrogenase maturation protease superfamily  36.42 
 
 
179 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>