183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_2012 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 160 aa  313  6e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  52.59 
 
 		 161 aa  123  9e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  39.35 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  35.1 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 176 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.66 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  38.18 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.46 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  33.78 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.37 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  40.15 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  31.41 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  32.89 
 
 		 208 aa  68.2  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  33.54 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  29.22 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  36 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  36.96 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  35.42 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  35.42 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.62 
 
 		 172 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  36.51 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  36.51 
 
 		 175 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  27.95 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  27.95 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  32.89 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.55 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  32.26 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  35.24 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1968  hydrogenase maturation protease  31.39 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  29.46 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  31.08 
 
 		 257 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  27.92 
 
 		 202 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.79 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.56 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  35.92 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  40.54 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.67 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  30.28 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  28.67 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  28.48 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.99 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  25.71 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  34.71 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  28.57 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.33 
 
 		 1053 aa  57.4  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  27.81 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  33.81 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.11 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  39.17 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  35.85 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.21 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  39.17 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  28.67 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.04 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  26.57 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  34.45 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  34.34 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.82 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  29.29 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  27.78 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  29.22 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  27.7 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  26.99 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  28.48 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.66 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  27.46 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.67 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  30.19 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>