175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0085 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  70.99 
 
 
186 aa  247  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  65.68 
 
 
183 aa  231  3e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  67.31 
 
 
159 aa  217  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  53.14 
 
 
181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  52.9 
 
 
160 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  48.34 
 
 
160 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.83 
 
 
158 aa  123  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  47.33 
 
 
160 aa  119  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.04 
 
 
171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  47.33 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.51 
 
 
174 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  46.36 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.25 
 
 
174 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.88 
 
 
174 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.67 
 
 
182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  39.13 
 
 
166 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.99 
 
 
166 aa  97.1  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  34.36 
 
 
170 aa  89  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  35.81 
 
 
167 aa  72.4  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  34.44 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  36.36 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 
167 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  35.71 
 
 
160 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  34.93 
 
 
271 aa  64.7  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  35.71 
 
 
160 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.06 
 
 
195 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  32.14 
 
 
202 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  32.56 
 
 
221 aa  60.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  41.67 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  27.85 
 
 
206 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.86 
 
 
218 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  31.55 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  34.78 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  31.55 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  31.55 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  35.16 
 
 
202 aa  58.9  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.06 
 
 
154 aa  58.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 
257 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.46 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  29.41 
 
 
195 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 
1053 aa  55.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.38 
 
 
188 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.19 
 
 
152 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  28.78 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  29.61 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  29.46 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  29.33 
 
 
198 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  28.48 
 
 
165 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  32.52 
 
 
223 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 
206 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  35.19 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 
222 aa  53.1  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  31.2 
 
 
224 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.5 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  28.83 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.5 
 
 
164 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  30.3 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.3 
 
 
201 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  29.33 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  32.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.31 
 
 
174 aa  52.4  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.01 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  29.33 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.5 
 
 
164 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.87 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 
161 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  29.33 
 
 
198 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  29.33 
 
 
198 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 
156 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.87 
 
 
164 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  24.46 
 
 
137 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  30.94 
 
 
159 aa  51.6  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.87 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  37.84 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  32.23 
 
 
168 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.87 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.87 
 
 
164 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  31.87 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29.03 
 
 
209 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.87 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28.97 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  32 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  31.87 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  28.97 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  28.97 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  28.97 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  30.68 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>