152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0195 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  100 
 
 		 174 aa  352  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  97.7 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  97.7 
 
 		 174 aa  347  4e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  87.72 
 
 		 171 aa  312  9.999999999999999e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  68.24 
 
 		 182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.18 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.46 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  44.65 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.18 
 
 		 166 aa  124  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.24 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  43.03 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.9 
 
 		 160 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.51 
 
 		 181 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.42 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  40.13 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  40.62 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  36.42 
 
 		 181 aa  94  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  34.97 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 170 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  29.68 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.32 
 
 		 221 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  40 
 
 		 224 aa  64.3  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  38.37 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  30.26 
 
 		 167 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.78 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  33.12 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  36.05 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.3 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  34.04 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  32.03 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  34.83 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  34.83 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  34.83 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  34.83 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  34.83 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  34.88 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  34.12 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  36.71 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.57 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  32.58 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  34.12 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  38.82 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 		 222 aa  54.3  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  34.12 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  29.22 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  27.15 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  34.88 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  31.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  31.21 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  31.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  31.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  31.21 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  31.76 
 
 		 198 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  36.47 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  27.22 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  34 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  28.93 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  30.57 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  30.13 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  25.16 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  27.68 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 		 165 aa  51.2  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  35.56 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  29.17 
 
 		 184 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  31.91 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  27.1 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  27.1 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  32.94 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  36.05 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  31.45 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1762  hydrogenase expression/formation protein  27.04 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 160 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  28.93 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  26.39 
 
 		 157 aa  48.5  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  28.57 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  32.58 
 
 		 204 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 157 aa  48.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>