117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0478 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 181 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  53.14 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  50.28 
 
 		 186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  47.22 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  48.73 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  46.71 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.68 
 
 		 160 aa  98.2  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  41.03 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  36.42 
 
 		 174 aa  94  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  34.57 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  41.03 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  35.19 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  35.85 
 
 		 171 aa  90.5  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  33.33 
 
 		 158 aa  89.4  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  35.67 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  35.67 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  33.13 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  27.78 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.66 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 		 165 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.9 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  25.49 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  37.37 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  34.02 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.45 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  30 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  33.01 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  35.85 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  28.67 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.81 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  37.04 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  33.68 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  27.84 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  28.12 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  28.4 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  23.9 
 
 		 257 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  34.57 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 152 aa  51.2  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  25.58 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  34.57 
 
 		 222 aa  49.7  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  26.67 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  29.25 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  33.73 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 		 201 aa  48.5  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  26.99 
 
 		 161 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  33.02 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  30.68 
 
 		 195 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  29.41 
 
 		 168 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  32.5 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.89 
 
 		 198 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  30.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  30.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.55 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29.11 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  30.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  30.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  30.68 
 
 		 195 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  31.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  31.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  31.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.82 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  30.68 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  27.68 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.63 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.11 
 
 		 169 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  23.27 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  28.57 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  29.7 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  35.71 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  25.97 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  35.53 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.99 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  26.99 
 
 		 166 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  30.59 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  26.79 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  27.22 
 
 		 160 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  28 
 
 		 157 aa  45.1  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  32.53 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  27.7 
 
 		 166 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  35.53 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1579  hydrogenase maturation protease  26.19 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  29.76 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  31.08 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.25 
 
 		 1053 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 165 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  32.47 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>