114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0322 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  100 
 
 		 154 aa  303  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  33.75 
 
 		 167 aa  91.7  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  37.68 
 
 		 147 aa  90.5  8e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  32.17 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  29.3 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  25.48 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  35.43 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  34.06 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  35.71 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  36.22 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  34.81 
 
 		 181 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  32.54 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  35.43 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  35.43 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  29.3 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  28.3 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  35.34 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  28.85 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  35.8 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  31.88 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  35.62 
 
 		 161 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  32.87 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  31.47 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  29.53 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  33.06 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  29.73 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  30.08 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  30.82 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  27.27 
 
 		 183 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 		 176 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  31.43 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  31.43 
 
 		 158 aa  50.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.63 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.31 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.41 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  30.71 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.15 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  30.08 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  29.27 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  30.87 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  29.55 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  28.06 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  29.37 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  30.13 
 
 		 173 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  26.12 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 271 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  26.03 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  29.13 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  29.14 
 
 		 221 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.82 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 		 188 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  28.22 
 
 		 224 aa  43.9  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  27.92 
 
 		 201 aa  43.9  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.49 
 
 		 182 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.38 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30.46 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1579  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  36.9 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.87 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  36.9 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  36.78 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  24.44 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  28.17 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.95 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.04 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  25.77 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.04 
 
 		 160 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  28.57 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.35 
 
 		 174 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  25.66 
 
 		 207 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.77 
 
 		 174 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>