181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0648 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  100 
 
 
160 aa  321  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  80.62 
 
 
160 aa  254  3e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  80 
 
 
160 aa  251  3e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  77.22 
 
 
159 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  64.56 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  46.99 
 
 
166 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.9 
 
 
174 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.9 
 
 
171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  46.36 
 
 
181 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.68 
 
 
174 aa  137  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  43.29 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  45.68 
 
 
182 aa  133  8e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  48.8 
 
 
166 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  44.74 
 
 
186 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  44.08 
 
 
183 aa  122  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  40.38 
 
 
159 aa  117  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  35.67 
 
 
181 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  38.75 
 
 
160 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 
170 aa  90.5  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  33.54 
 
 
221 aa  77.4  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.72 
 
 
222 aa  76.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  30.86 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  34.62 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  29.09 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  32.89 
 
 
224 aa  67.8  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  30.12 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 
160 aa  67  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  30.12 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  26.28 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  27.1 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  32.05 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  33.77 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  30.97 
 
 
208 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.87 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  27.74 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29.6 
 
 
209 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  29.81 
 
 
195 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  26.8 
 
 
195 aa  61.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
160 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.52 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.49 
 
 
201 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.17 
 
 
170 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 
159 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 
203 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  29.68 
 
 
208 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
160 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.32 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  30.38 
 
 
176 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  29.41 
 
 
159 aa  57.4  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.77 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 
202 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 
191 aa  55.1  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 
165 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 
165 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  27.1 
 
 
195 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.26 
 
 
175 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  35.53 
 
 
195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 
202 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 
202 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 
202 aa  54.3  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  34.18 
 
 
195 aa  53.9  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  34.18 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  34.18 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  34.18 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  31.3 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  27.7 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 
158 aa  53.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 
202 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  34.18 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  24.55 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  34.18 
 
 
195 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  23.95 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  31.25 
 
 
198 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  32.47 
 
 
198 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.66 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  28.46 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 
157 aa  52  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  31.25 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  31.25 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  31.25 
 
 
198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  29.61 
 
 
201 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  26.58 
 
 
204 aa  52  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  23.87 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 
176 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  29.66 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  29.86 
 
 
170 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  29.66 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>