38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1579 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1579  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 169 aa  337  4e-92  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  72.62 
 
 		 170 aa  252  2.0000000000000002e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  64.85 
 
 		 171 aa  226  8e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  63.64 
 
 		 171 aa  225  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0455702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 202 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  30.57 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  35.66 
 
 		 177 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  24.03 
 
 		 182 aa  45.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.29 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  22.7 
 
 		 177 aa  44.3  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  26.19 
 
 		 181 aa  44.3  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  34.25 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  34.25 
 
 		 195 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  33.7 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  27.5 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  34.25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  34.25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  34.25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  34.25 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  34.25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  34.25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  35.14 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.67 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  34.25 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  29.8 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.76 
 
 		 1053 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  35.06 
 
 		 223 aa  41.2  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  28.76 
 
 		 165 aa  40.8  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  38.36 
 
 		 224 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  28 
 
 		 167 aa  40.8  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>