80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0408 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
171 aa  340  5e-93  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  88.3 
 
 
171 aa  314  4e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0455702 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  74.7 
 
 
170 aa  254  4e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1579  hydrogenase maturation protease  64.85 
 
 
169 aa  226  8e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  25.62 
 
 
177 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  30.52 
 
 
202 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  25.99 
 
 
182 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  29.87 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  29.87 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  29.87 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  29.87 
 
 
202 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  34.81 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 
170 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  25.95 
 
 
201 aa  51.2  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  29.3 
 
 
164 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  29.17 
 
 
194 aa  48.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.54 
 
 
181 aa  48.5  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1164  HyaD peptidase  27.22 
 
 
198 aa  48.1  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  29.8 
 
 
214 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  26.11 
 
 
206 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  26.53 
 
 
157 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  28.57 
 
 
208 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  24.43 
 
 
206 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  28.82 
 
 
167 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  29.27 
 
 
208 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  27.27 
 
 
181 aa  45.8  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  24.43 
 
 
206 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.28 
 
 
195 aa  45.4  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  28.29 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  34.02 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
157 aa  44.7  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  28.95 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  29.27 
 
 
218 aa  44.3  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0462  hydrogenase maturation protease HydD  24.69 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000346095  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1400  hydrogenase maturation protease HydD  25.77 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  33.33 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  34.62 
 
 
203 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2030  hydrogenase expression/formation protein  21.98 
 
 
185 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468392  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  34.67 
 
 
195 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.1 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.54 
 
 
198 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  22.83 
 
 
185 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  25 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  24.34 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  24.44 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  32.91 
 
 
222 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  32.22 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1280  hydrogenase maturation protease HydD  25.77 
 
 
178 aa  42.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00834079  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.54 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  32.22 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  27.54 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  32.22 
 
 
198 aa  42.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  24.82 
 
 
140 aa  42  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0916  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.712591  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  29.27 
 
 
158 aa  42  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0937  hydrogenase maturation protease HydD  22.1 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.353395  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.09 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  25.78 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>