176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2796 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 167 aa  343  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.75 
 
 		 154 aa  91.7  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  25.48 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  27.45 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  27.39 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  26.92 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  26.95 
 
 		 181 aa  67.4  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  33.81 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.53 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  32.35 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 176 aa  61.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  28.99 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.92 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.92 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.92 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.87 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.28 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  30.5 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.28 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.28 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.92 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  30.92 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  28.67 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.28 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  28.17 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.58 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  30.71 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  34.46 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  30.14 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  30.95 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  26.95 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  26.06 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  30.95 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  29.65 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  27.92 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  31.03 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  31.47 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  26.95 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  26.95 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  27.66 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  27.41 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  29.58 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  34.81 
 
 		 171 aa  52.4  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  26.24 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  29.93 
 
 		 150 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  30.16 
 
 		 195 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.66 
 
 		 224 aa  52  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  26.24 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  27.97 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29.13 
 
 		 209 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  29.5 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  24.83 
 
 		 185 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  29.79 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  31.39 
 
 		 206 aa  50.8  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  28.91 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  29.5 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  25.69 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1103  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  27.88 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  30.87 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  27.59 
 
 		 166 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  32.85 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0455702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>