62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01030 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  100 
 
 		 172 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  46.98 
 
 		 161 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  44.68 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  45.26 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  42.45 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  41.3 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  40.58 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  40.58 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  40.58 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  42.03 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  40.71 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  40.58 
 
 		 156 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  35.66 
 
 		 147 aa  85.5  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  35.06 
 
 		 201 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  37.41 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  31.47 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  30.94 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  34.17 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  33.33 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.47 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  30.7 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 		 271 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  20.73 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  24.29 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  29.5 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  20.47 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 257 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  27.39 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  20.38 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  34.87 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  29.3 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.25 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 		 160 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.66 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.03 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 		 186 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.43 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  31.15 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  27.21 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.37 
 
 		 172 aa  44.7  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  28.68 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  24.75 
 
 		 181 aa  44.7  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 		 175 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  27.43 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.15 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  24.39 
 
 		 176 aa  40.8  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.95 
 
 		 171 aa  40.8  0.01  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 167 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>