129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0405 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  100 
 
 		 179 aa  353  7.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  91.62 
 
 		 179 aa  329  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  92.74 
 
 		 179 aa  310  9e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  74.3 
 
 		 181 aa  256  2e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  48.31 
 
 		 193 aa  174  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  40.69 
 
 		 147 aa  105  5e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  35.03 
 
 		 147 aa  95.5  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  30.49 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  31.74 
 
 		 189 aa  90.5  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 201 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.3 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  33.11 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  27.54 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  27.45 
 
 		 161 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  26.32 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  27.22 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  26.97 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  27.63 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  27.08 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  23.68 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  27.38 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  28.07 
 
 		 209 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  26.39 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  25 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  26.39 
 
 		 156 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  25 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  26.79 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  20.47 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  29.19 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  27.92 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  24.58 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  25.93 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  25.77 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  24.42 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  26.92 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.22 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  27.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  27.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  27.49 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  27.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  27.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  23.68 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  25.97 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  27.27 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  27.61 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  26.79 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  26.71 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  25 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  26 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  24.84 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  28.14 
 
 		 170 aa  50.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  24.24 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  25.15 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  26 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  25 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  26 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  22.94 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  24.09 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  25.79 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  23.93 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.36 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  26.19 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  28.47 
 
 		 165 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  27.63 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  25.81 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  25.18 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  22.36 
 
 		 208 aa  47.8  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  26.58 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  22.88 
 
 		 202 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  25.62 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  22.88 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  22.88 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  22.88 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  22.88 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3986  HyaD peptidase  24.22 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  22.35 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  27.71 
 
 		 164 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  22.56 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.79 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.31 
 
 		 156 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  25.44 
 
 		 156 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  24.54 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  27.14 
 
 		 185 aa  44.7  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  22.29 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  24.29 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  30.63 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>