100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0694 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
147 aa  286  8e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  39.31 
 
 
181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  40.26 
 
 
179 aa  105  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  41.94 
 
 
181 aa  102  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  34.72 
 
 
147 aa  101  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  39.61 
 
 
179 aa  98.6  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  39.61 
 
 
179 aa  98.2  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  35.62 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  33.8 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  32.62 
 
 
165 aa  88.6  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 
159 aa  88.6  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  36.72 
 
 
158 aa  87  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  33.81 
 
 
172 aa  87  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  35.16 
 
 
151 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  34.31 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  32.85 
 
 
156 aa  84.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0451104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  33.57 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  36.42 
 
 
193 aa  84.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  34.85 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  32.85 
 
 
156 aa  84.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  35.16 
 
 
156 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  33.58 
 
 
156 aa  84.3  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  35.94 
 
 
156 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.62 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  32.03 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  34.75 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  29.5 
 
 
148 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  29.29 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  30.88 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  30.83 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  30.56 
 
 
148 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 
157 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  26.57 
 
 
184 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  30.56 
 
 
167 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.72 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  27.82 
 
 
171 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 
164 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 
152 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.1 
 
 
153 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.58 
 
 
172 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  33.08 
 
 
154 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 
177 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  30.6 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  28.89 
 
 
150 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  24.18 
 
 
257 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  23.24 
 
 
151 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  25.97 
 
 
180 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  31.78 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  31.78 
 
 
175 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.08 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  25.56 
 
 
176 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  26.24 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 
177 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  26.57 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  23.23 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  23.23 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  24.82 
 
 
271 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  25.52 
 
 
172 aa  43.9  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  29.63 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  30.53 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.11 
 
 
166 aa  43.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.41 
 
 
183 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  25.35 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  25 
 
 
170 aa  42  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.34 
 
 
174 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 
173 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 
160 aa  42  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  29.14 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  22.58 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 
186 aa  41.2  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  23.85 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  28.79 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  28 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  22.58 
 
 
161 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  24.83 
 
 
157 aa  41.2  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.97 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.39 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  28.17 
 
 
157 aa  41.2  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.57 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 
176 aa  40.8  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  28.79 
 
 
198 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  26.54 
 
 
194 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  30.08 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  23.31 
 
 
166 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 
160 aa  40.4  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.59 
 
 
166 aa  40.8  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  28.46 
 
 
163 aa  40  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>