46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0598 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  56.02 
 
 		 189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  32.61 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  32.88 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  33.54 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  36 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  32.41 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  35.86 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  30.68 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  35.17 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  37.7 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  35.06 
 
 		 172 aa  74.3  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  35.17 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  34.48 
 
 		 156 aa  74.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.8 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  34.69 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  35.17 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  35.51 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  34.48 
 
 		 156 aa  72  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  30.5 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  33.79 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  34.96 
 
 		 156 aa  65.9  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  29.66 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  36.45 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  35.59 
 
 		 148 aa  57.8  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  32.52 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  36.04 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  35.07 
 
 		 163 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  31.78 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  27.04 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  30.61 
 
 		 181 aa  48.5  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  29.69 
 
 		 167 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  29.69 
 
 		 167 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  25.62 
 
 		 160 aa  42  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  29.58 
 
 		 176 aa  42  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>