58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2426 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  100 
 
 		 156 aa  317  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  66.89 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  66.89 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  66.89 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  66.89 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  66.67 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  66.23 
 
 		 156 aa  214  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  60.26 
 
 		 151 aa  202  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  56.76 
 
 		 165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  58.39 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  53.57 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  54.68 
 
 		 161 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  42.03 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  47.5 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  43.61 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  35.94 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  32.39 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.71 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  31.76 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  37.76 
 
 		 189 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  38.05 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  35.09 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  34.96 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  27.74 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  26.43 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  23.03 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  29.58 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  24.5 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  23.68 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  23.03 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  31.91 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.34 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.95 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.34 
 
 		 171 aa  44.3  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  27.54 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.09 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.71 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.08 
 
 		 172 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  29.51 
 
 		 186 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  26.98 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  26.98 
 
 		 198 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  27.48 
 
 		 137 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  26.98 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  27.5 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  27.5 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  27.87 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.84 
 
 		 183 aa  40.4  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>