46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1508 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 163 aa  314  3e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  33.56 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0694  hydrogenase maturation protease  30.95 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2182  hydrogenase 3 maturation protease  33.33 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.359585 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.23 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  23.46 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  29.79 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  34.71 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  29.63 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  29.63 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  35.07 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  32.58 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  26.28 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  28.89 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  29.85 
 
 		 148 aa  51.6  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  31.2 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  29.46 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  29.46 
 
 		 156 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  29.46 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  31.43 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  33.64 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  34.87 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0405  HycI peptidase  24.58 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 189 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  20.65 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.61 
 
 		 169 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2728  hydrogenase maturation protease HycI  30.46 
 
 		 181 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1488  hydrogenase maturation protease HycI  21.23 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.97 
 
 		 172 aa  43.9  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  32.41 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  23.26 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 165 aa  42.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 		 157 aa  42  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  36.46 
 
 		 180 aa  41.6  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2426  hydrogenase 3 maturation protease  28.57 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  30.57 
 
 		 178 aa  40.8  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  29.25 
 
 		 176 aa  40.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>