193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1139 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 157 aa  310  5.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  43.51 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  38.96 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  40.54 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  40.54 
 
 		 166 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  37.91 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  40.26 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  41.09 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.67 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  38.24 
 
 		 148 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  38.78 
 
 		 160 aa  85.1  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  40.74 
 
 		 166 aa  83.6  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  35.03 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  48.61 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  37.97 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  33.53 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  32.37 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  32.33 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  38.51 
 
 		 180 aa  74.3  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.91 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  32.88 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  36.94 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  32.92 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  35.62 
 
 		 169 aa  69.7  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  33.76 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  33.76 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  36.96 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.52 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  36.91 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  36.91 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  33.12 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.08 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  30.83 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.08 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.08 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.08 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.77 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  33.08 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.87 
 
 		 182 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.93 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  28.85 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  32.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  31.08 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  32.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.21 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.09 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.92 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  29.41 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  34.51 
 
 		 271 aa  61.2  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  32.69 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.32 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.32 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.33 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  31.34 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.34 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.34 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.34 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0857  hydrogenase maturation protease  28 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.685665  normal  0.316463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  34.35 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  29.81 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  31.51 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  28.99 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  34.25 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  30.2 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.71 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  29.38 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  26.85 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  26.85 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  34.17 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  33.11 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.82 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  28.75 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  29.1 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  32.09 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.3 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  28.67 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  29.53 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  31.75 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  27.92 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 191 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  29.08 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 257 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  32.64 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  27.52 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>