136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1819 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  71.9 
 
 
153 aa  238  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  71.52 
 
 
161 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  71.52 
 
 
161 aa  233  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  71.43 
 
 
157 aa  232  1.0000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  69.68 
 
 
157 aa  231  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  58.21 
 
 
158 aa  157  7e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  49.32 
 
 
157 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  49.32 
 
 
157 aa  154  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  51.77 
 
 
157 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  45.89 
 
 
188 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  47.52 
 
 
271 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  50.38 
 
 
161 aa  134  7.000000000000001e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  48.25 
 
 
173 aa  130  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  44.22 
 
 
257 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  40.67 
 
 
158 aa  113  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  52.27 
 
 
92 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.03 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.46 
 
 
169 aa  73.9  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  35.42 
 
 
166 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  25.68 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 
160 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  31.51 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.94 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.85 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.15 
 
 
172 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.68 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  27.59 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.68 
 
 
164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  32.03 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.37 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.37 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.37 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.37 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.37 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.17 
 
 
176 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 
157 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.69 
 
 
174 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 
156 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  28.1 
 
 
169 aa  57.4  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  31.34 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  31.11 
 
 
176 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  30.11 
 
 
156 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  25.74 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  29.75 
 
 
161 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  25.68 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  33.7 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  30.28 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  35.64 
 
 
170 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  27.46 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  23.93 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.19 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.68 
 
 
174 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  25.17 
 
 
159 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.28 
 
 
171 aa  50.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.7 
 
 
174 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  29.17 
 
 
159 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  29.86 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.11 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  27.4 
 
 
223 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  26.88 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  25.16 
 
 
224 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  25.17 
 
 
161 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  24.81 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  26.71 
 
 
180 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  31.37 
 
 
181 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 
161 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  29.03 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  28.89 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  27.85 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  24.49 
 
 
183 aa  48.5  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  28.76 
 
 
168 aa  48.5  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  27.52 
 
 
181 aa  47.8  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  25.77 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 
158 aa  47.4  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  26.32 
 
 
202 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  26.32 
 
 
202 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  26.32 
 
 
202 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  26.32 
 
 
202 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  24.38 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  26.71 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  25.98 
 
 
195 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>