17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0464 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  100 
 
 		 92 aa  188  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  81.18 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  54.12 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  52.27 
 
 		 157 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  54.88 
 
 		 153 aa  91.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  50 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  51.35 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  51.35 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  47.5 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  47.5 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  48.65 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  58.06 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  46.67 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  47.3 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  44.59 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  43.59 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  34.57 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>