155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2367 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
257 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  63.45 
 
 
271 aa  310  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  64.49 
 
 
157 aa  191  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  64.08 
 
 
188 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  52.2 
 
 
173 aa  168  7e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  44.22 
 
 
157 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  45.95 
 
 
153 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  41.72 
 
 
157 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  40 
 
 
157 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  40.4 
 
 
161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  40.4 
 
 
161 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  43.54 
 
 
157 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  43.54 
 
 
157 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  48.06 
 
 
158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  40.77 
 
 
161 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3803  hydrogenase maturation protease  52.63 
 
 
101 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 
158 aa  92.8  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0473  hydrogenase maturation protease  51.14 
 
 
103 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 
172 aa  75.5  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  33.79 
 
 
169 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.07 
 
 
172 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  31.43 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 
159 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.97 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 
152 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  32.39 
 
 
176 aa  67  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  27.97 
 
 
160 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.47 
 
 
207 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  27.46 
 
 
164 aa  62.4  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  43.59 
 
 
92 aa  62.4  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.21 
 
 
160 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.08 
 
 
160 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 
160 aa  59.7  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.17 
 
 
175 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  34.4 
 
 
161 aa  58.9  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  28.67 
 
 
166 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.33 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  31.43 
 
 
170 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.73 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 
166 aa  57  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.65 
 
 
182 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 
165 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 
177 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  23.13 
 
 
166 aa  55.8  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  34.62 
 
 
159 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  27.5 
 
 
161 aa  55.5  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 
166 aa  55.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  26.03 
 
 
165 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  37.97 
 
 
160 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  31.08 
 
 
186 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.87 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  31.87 
 
 
166 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  28.74 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 
175 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 
175 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  32.54 
 
 
144 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.94 
 
 
1053 aa  53.5  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.03 
 
 
161 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  29.49 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  28.06 
 
 
168 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  40.26 
 
 
170 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  41.67 
 
 
183 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  30.5 
 
 
159 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  29.79 
 
 
177 aa  52.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 
157 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  31.31 
 
 
159 aa  52.4  0.000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  23.9 
 
 
181 aa  52  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.34 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 
170 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
150 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  27.97 
 
 
221 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  35.66 
 
 
169 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  33.12 
 
 
158 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  43.28 
 
 
170 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  27.11 
 
 
184 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  28.68 
 
 
165 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.45 
 
 
159 aa  49.7  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  29 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  30.65 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  30 
 
 
169 aa  48.9  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 
191 aa  48.9  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.65 
 
 
183 aa  48.9  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  24.36 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.14 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  30.14 
 
 
176 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.14 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  30.71 
 
 
172 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  35.82 
 
 
159 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  27.85 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28 
 
 
195 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  28.78 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  28 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  28.78 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  28 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  35.21 
 
 
167 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  28 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  28 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  27.54 
 
 
164 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>