165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3367 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 157 aa  325  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  78.38 
 
 		 153 aa  251  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  76.35 
 
 		 157 aa  244  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  72.11 
 
 		 161 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  72.11 
 
 		 161 aa  242  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  69.68 
 
 		 157 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  56.38 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  47.3 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  47.3 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  48.68 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  53.79 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  46.67 
 
 		 188 aa  141  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  46.67 
 
 		 271 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  45.27 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  41.67 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  41.72 
 
 		 257 aa  121  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  50 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  28.28 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  31.82 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.14 
 
 		 172 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  33.78 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  32.68 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  29.8 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 		 172 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.95 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.95 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.63 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.14 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.63 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.63 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.63 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.63 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  28.1 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  32.03 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.29 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  29.1 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  27.81 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  37.63 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  33.74 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.65 
 
 		 160 aa  59.7  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  26.14 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  31.11 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  27.74 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.08 
 
 		 184 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  29.77 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  24.34 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  32.29 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  25.66 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  39.22 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  25.5 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.45 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  31.75 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.32 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28.26 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  28.97 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  26.8 
 
 		 224 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  29.8 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.26 
 
 		 195 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  35.19 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  30.82 
 
 		 177 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.25 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  25.66 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  28.68 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  28.26 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  29.8 
 
 		 176 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  24.55 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  26.47 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.66 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.24 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  28.28 
 
 		 223 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.33 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  24.65 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  31.15 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.92 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1351  hydrogenase maturation protease HycI  25.29 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.648284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>