189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3225 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 271 aa  535  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  63.45 
 
 		 257 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  69.93 
 
 		 157 aa  214  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  63.12 
 
 		 188 aa  203  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  56.8 
 
 		 173 aa  192  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  46.67 
 
 		 157 aa  140  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  48 
 
 		 153 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  45.58 
 
 		 157 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  44.37 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  44.37 
 
 		 161 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  43.23 
 
 		 157 aa  131  9e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  46.21 
 
 		 158 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  43.75 
 
 		 161 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  42.47 
 
 		 157 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  42.47 
 
 		 157 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  37.42 
 
 		 158 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0473  hydrogenase maturation protease  57.14 
 
 		 103 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  32.43 
 
 		 160 aa  88.2  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  32.43 
 
 		 160 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  31.76 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3803  hydrogenase maturation protease  51.04 
 
 		 101 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 159 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  32.12 
 
 		 137 aa  78.2  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 172 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  30.46 
 
 		 159 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  31.54 
 
 		 169 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  31.61 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  26.85 
 
 		 164 aa  72  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  35.06 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  34.69 
 
 		 176 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  29.52 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  46.25 
 
 		 92 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  30.41 
 
 		 168 aa  70.5  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  28.86 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.82 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 		 160 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  27.81 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  29.45 
 
 		 161 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  34.67 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  33.76 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  32.05 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  29.14 
 
 		 170 aa  64.7  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 		 177 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.14 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  30.2 
 
 		 183 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  34.88 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  37.84 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  27.52 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.87 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  26.8 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.37 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  30.2 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  31.13 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  32.56 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.5 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  29.01 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  29.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.01 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  31.01 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  27.95 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.93 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  27.22 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.77 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  40.7 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.77 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.77 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  28.1 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  30.08 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  32.72 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  32.09 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  26.32 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.49 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.19 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.49 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  29.49 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.57 
 
 		 164 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  32.17 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  35.14 
 
 		 159 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  32.16 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  32.04 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  25.66 
 
 		 166 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  27.97 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  31.34 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  31.29 
 
 		 181 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  32.04 
 
 		 195 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  32.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  32 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  32.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  32.04 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  32.04 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>