133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3885 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  41.67 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  38.56 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  38.56 
 
 		 161 aa  117  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  42.76 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  40.67 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  40.94 
 
 		 153 aa  111  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  43.18 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.82 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  41.13 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  40.58 
 
 		 173 aa  94  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 257 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  35.33 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 271 aa  92  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  39.71 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.37 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  33.12 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  29.5 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  40.96 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  34.38 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  34.94 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  28.93 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.87 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  34.18 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.88 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0464  hydrogenase maturation protease HyaD  34.57 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496486 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  26.62 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.29 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  32.94 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  29.27 
 
 		 165 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  26.75 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.37 
 
 		 1053 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  38.03 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  32.91 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  30.2 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  28.3 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  23.75 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.21 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  32.17 
 
 		 223 aa  48.5  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  28.66 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11780  hydrogenase maturation protease  29 
 
 		 179 aa  47.4  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0353355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.27 
 
 		 172 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30.67 
 
 		 221 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  29.77 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  32.91 
 
 		 184 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  30.5 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  33.72 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  23.23 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  29.63 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.71 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.85 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.26 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  31.17 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  25.64 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  36.14 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  25.17 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.85 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  29.93 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  25.17 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  28.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  28.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  34.12 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  28.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  28.3 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  28.3 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  29.03 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  25.58 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0432  hydrogenase maturation protease HycI  25.29 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.632928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  32.56 
 
 		 165 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  35.56 
 
 		 170 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  25.95 
 
 		 159 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.68 
 
 		 164 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  26.75 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  26.67 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  26.67 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>