149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3681 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 163 aa  318  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  32.93 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  33.1 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  34.17 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  33.54 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  28.38 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4291  hydrogenase maturation protease  43.9 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4313  hydrogenase maturation protease  41.67 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  42.15 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  28.95 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  30.54 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  28.69 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  35.85 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.3 
 
 		 218 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  33.06 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  28.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  28.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  32.69 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  28.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  35.37 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  33.56 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.57 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  37.04 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.52 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1244  hydrogenase expression/formation protein  34.57 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.791163  normal  0.298279 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  32.74 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0335  hydrogenase expression/formation protein  29.86 
 
 		 191 aa  53.9  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00352637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  24.34 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  25.87 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  34.71 
 
 		 191 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  30.49 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2036  peptidase M52, hydrogen uptake protein  21.33 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.89 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  28.8 
 
 		 198 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 		 166 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  28.69 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  29.03 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  27.7 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  29.03 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  29.03 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  29.03 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  25.5 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  25.47 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.42 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  26.17 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 195 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  28.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  28.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  26.75 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  28.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  32.23 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.82 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 195 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 		 202 aa  50.4  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  25.9 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.14 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  29.46 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  30.49 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.09 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  29.61 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  31.91 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  30.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  28.23 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.28 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  32.73 
 
 		 175 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  33.02 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  31.13 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  27.94 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  32.73 
 
 		 175 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4305  hydrogenase maturation protease  38.58 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.613236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2106  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  30.3 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.03 
 
 		 1053 aa  47.8  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1905  hydrogenase expression/formation protein  25.56 
 
 		 185 aa  47.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  26.25 
 
 		 222 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  36 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>