140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4313 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4313  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
173 aa  318  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4291  hydrogenase maturation protease  95.62 
 
 
171 aa  207  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4161  peptidase M52, hydrogen uptake protein  96.09 
 
 
156 aa  194  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0284488  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4305  hydrogenase maturation protease  77.34 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.613236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  36.5 
 
 
159 aa  85.1  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  43.44 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  38.57 
 
 
191 aa  71.6  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  38.65 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3969  hydrogenase maturation protease  35.95 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000953733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.33 
 
 
154 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  33.12 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  38.06 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  34.59 
 
 
178 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  33.12 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  40.29 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3881  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  37.74 
 
 
191 aa  62.4  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  32.92 
 
 
166 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  35.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
222 aa  60.8  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  35.66 
 
 
164 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  35.66 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.06 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.88 
 
 
177 aa  60.5  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.66 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.66 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  35.66 
 
 
164 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0051  hydrogenase maturation protease  30.33 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0212564  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  34.46 
 
 
160 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.27 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.27 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.27 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  34.59 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  34.59 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.27 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  34.27 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  35.67 
 
 
169 aa  58.2  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  34.21 
 
 
176 aa  58.5  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.93 
 
 
156 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  36.23 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.77 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  36.96 
 
 
157 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  36.5 
 
 
170 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.57 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2530  hydrogenase expression/formation protein  32.45 
 
 
169 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.780336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  38.46 
 
 
171 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  30.71 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  32.87 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  35.62 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  28.75 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  31.11 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  33.33 
 
 
206 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2026  HyaD peptidase  31.69 
 
 
208 aa  52  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.462165  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  35.44 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  33.33 
 
 
206 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.75 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 
202 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 
202 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 
202 aa  51.2  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  26.97 
 
 
221 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  33.8 
 
 
271 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 
172 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.68 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.32 
 
 
202 aa  50.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 
180 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  31.58 
 
 
214 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  32.19 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  32.69 
 
 
166 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  31.41 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  31.94 
 
 
201 aa  47.8  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  29.73 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.69 
 
 
153 aa  47.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.87 
 
 
160 aa  47  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  27.46 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  32.65 
 
 
257 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  25.9 
 
 
223 aa  47  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  30.87 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  37.01 
 
 
175 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  37.01 
 
 
175 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  27.46 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.23 
 
 
1053 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  28.48 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  32.31 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  30.23 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  25.2 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  26.83 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0173  hydrogenase maturation protease  29.68 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  26.83 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>