85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1020 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
180 aa  345  1e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  41.35 
 
 
177 aa  91.3  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  37.25 
 
 
166 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  32.54 
 
 
180 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  38.78 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  38.18 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  38.51 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  37.04 
 
 
171 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  33.99 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  37.09 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
157 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  34.67 
 
 
181 aa  59.7  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  31.41 
 
 
169 aa  58.2  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  28.3 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1650  hydrogenase maturation protease  38.58 
 
 
161 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  32.19 
 
 
152 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.57 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  33.57 
 
 
166 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2422  hydrogenase maturation protease  36.05 
 
 
155 aa  55.1  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.873028  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  34.87 
 
 
177 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  30.64 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  25.83 
 
 
161 aa  52.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  27.92 
 
 
160 aa  52  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
160 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  25.6 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  32.68 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  32.31 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  33.77 
 
 
154 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  24.49 
 
 
166 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  27.33 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.71 
 
 
174 aa  49.3  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  29.06 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  29.14 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  38.46 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  27.92 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.23 
 
 
175 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
167 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 
218 aa  47.8  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 
177 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  29.71 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  27.39 
 
 
166 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  32.24 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 
160 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 
191 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  28.99 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  21.74 
 
 
137 aa  44.7  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 
271 aa  44.7  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 
157 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  31.21 
 
 
157 aa  44.7  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1449  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.37 
 
 
158 aa  44.3  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.230112  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  34.72 
 
 
150 aa  44.3  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  23.49 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0501  hydrogenase maturation protease HycI  22.41 
 
 
181 aa  43.9  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.812223  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  27.74 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  30 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  23.49 
 
 
159 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  41.58 
 
 
170 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  28.78 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 
151 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  31.68 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  27.1 
 
 
221 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  26.06 
 
 
222 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  29.5 
 
 
214 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 
163 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  28.17 
 
 
184 aa  42  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  29.79 
 
 
206 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  28.8 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  26.53 
 
 
165 aa  41.6  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  28.8 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  28.8 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  28.8 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  28.8 
 
 
198 aa  41.6  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1271  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.91 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.813931  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1590  hydrogenase maturation protease  25.85 
 
 
160 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  27.4 
 
 
181 aa  41.2  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  55.26 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  27.05 
 
 
195 aa  41.2  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1508  hydrogenase maturation protease  36.46 
 
 
163 aa  41.2  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.263436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4291  hydrogenase maturation protease  39.6 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4566  hydrogenase 3 maturation protease  31.39 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0120  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 
144 aa  41.2  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>