38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1675 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  55.15 
 
 
147 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  51.63 
 
 
180 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  59.52 
 
 
156 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  52.32 
 
 
151 aa  143  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  51.09 
 
 
164 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  46.75 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  39.19 
 
 
178 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  40 
 
 
163 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  33.78 
 
 
152 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  38.03 
 
 
168 aa  81.3  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  34.04 
 
 
147 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  38.64 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  32.58 
 
 
158 aa  71.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  32.41 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  32.17 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  30.56 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  31.25 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  31.03 
 
 
146 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 
146 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 
146 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  32.43 
 
 
151 aa  57.8  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  25.35 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  25.35 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.58 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  26.49 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 
169 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  33.85 
 
 
167 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  30 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
173 aa  44.7  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.33 
 
 
188 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  27.43 
 
 
172 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  32.45 
 
 
160 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  31.58 
 
 
181 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>