75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04410 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  100 
 
 		 160 aa  301  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  52.35 
 
 		 180 aa  147  5e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  38.78 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  38.78 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  35 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  33.99 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  39.42 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  42.07 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  38.61 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  38.61 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.9 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  34.9 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  33.79 
 
 		 173 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  35.04 
 
 		 1053 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  35.57 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  34.11 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  34.62 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  34.87 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0786  hydrogenase maturation protease  27.67 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.88 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  35.94 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1347  hydrogenase maturation protease  35.48 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  33.56 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  30.07 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  32.65 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 		 271 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  37.25 
 
 		 167 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.22 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  27.81 
 
 		 159 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3145  hydrogenase expression/formation protein  33.11 
 
 		 159 aa  47.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  25.97 
 
 		 159 aa  47.4  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  32.84 
 
 		 164 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.45 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  32.84 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 176 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  25.32 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  32.65 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  29.93 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.67 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  33.6 
 
 		 160 aa  44.3  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3909  hydrogenase maturation protease  30.2 
 
 		 168 aa  44.3  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  29.61 
 
 		 180 aa  43.9  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  26.49 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  29.22 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  34.35 
 
 		 170 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  32.24 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  33.08 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  25.83 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  31.39 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.92 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1280  hydrogenase maturation protease  33.03 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  31.39 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  32.86 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 		 157 aa  42  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  28.93 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 176 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  32.45 
 
 		 181 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  24.05 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  24.05 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.57 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  26.45 
 
 		 176 aa  41.6  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 		 257 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  31.86 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  26.76 
 
 		 166 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1859  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 		 194 aa  40.4  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>