22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0983 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  100 
 
 		 166 aa  337  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  43.79 
 
 		 180 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  46.75 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  44.29 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  44.88 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  42.28 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  41.26 
 
 		 178 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  45.24 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  28.47 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  26.85 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  30.66 
 
 		 147 aa  52  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  25 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  26.38 
 
 		 173 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  31.39 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  31.39 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  30.66 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  30.26 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  26.03 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  29.22 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.34 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  27.48 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>