63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1555 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  100 
 
 		 155 aa  320  6e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  37.41 
 
 		 151 aa  97.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  34.27 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  35.71 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  31.72 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  37.23 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  34.65 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  32.41 
 
 		 178 aa  63.9  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  31.5 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  31.85 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  31.75 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  30.16 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  37.88 
 
 		 151 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  29.58 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  30.87 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  31.47 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  27.63 
 
 		 169 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3681  hydrogenase maturation protease  36.14 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.157783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  31.37 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  30.92 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  31.06 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  29.56 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  30.99 
 
 		 180 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  23.49 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  44.26 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  23.68 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.57 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  32.26 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  22.92 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  26.62 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  27.52 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1947  hydrogenase maturation protease  24.68 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  28.06 
 
 		 164 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  44.3  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  30.16 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  28.57 
 
 		 195 aa  43.9  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  30.92 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  28.57 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  27.34 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  23.68 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3135  hydrogenase maturation protease  26.21 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  23.68 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  26.14 
 
 		 152 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  27.94 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1318  hydrogenase maturation protease  25.97 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0362  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120918 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1127  hydrogenase maturation protease  25.52 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  26.81 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.68 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  36.25 
 
 		 271 aa  40.8  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2224  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 		 165 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1072  hydrogenase maturation protease  23.23 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00076364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>