29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4665 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  321  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  54.9 
 
 
173 aa  179  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  45.99 
 
 
151 aa  124  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  38.19 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  38.19 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  40.41 
 
 
152 aa  106  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  39.71 
 
 
152 aa  100  8e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  39.46 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  40.14 
 
 
147 aa  86.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  39.69 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  35.07 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  28.47 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.25 
 
 
155 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  32.58 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  36 
 
 
167 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  31.54 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  28.89 
 
 
146 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  28.15 
 
 
146 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  28.99 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  29.2 
 
 
163 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  29.79 
 
 
180 aa  50.8  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  24.18 
 
 
178 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.37 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  31.37 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  29.37 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  27.48 
 
 
166 aa  42.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>