23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2717 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  43.42 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  38.89 
 
 		 151 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  39.69 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  37.93 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 		 140 aa  79  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  35.2 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  35.2 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  36.43 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  38.19 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  37.5 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  36.81 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  36.3 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  36.81 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  33.11 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  34.65 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  37.88 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  32.43 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  34.07 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  28.38 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  27.61 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  36.97 
 
 		 167 aa  41.6  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  26.09 
 
 		 168 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>