31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3538 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  298  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  61.27 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  41.43 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  38.19 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  40.41 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  33.78 
 
 		 181 aa  83.6  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  35.17 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  44.26 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  42.31 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  35.66 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  35.66 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  34.97 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  28.67 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.67 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  34.72 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  31.94 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  28.77 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.41 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  28.03 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  33.81 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  33.06 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  34.23 
 
 		 166 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  35.25 
 
 		 171 aa  47  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  23.26 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  26.06 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  28.95 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>