27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1369 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  293  6e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  61.27 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  40.28 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  37.32 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  37.32 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  97.1  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  37.59 
 
 		 173 aa  95.1  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  34.04 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  36 
 
 		 169 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  36.17 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  41.27 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  34.46 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  33.8 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  33.8 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  33.78 
 
 		 160 aa  63.5  0.0000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.64 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.87 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  31.86 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  39.05 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  25.87 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  30.82 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  29.91 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  29.25 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  30.67 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>