35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0113 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  55.63 
 
 		 151 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  52.74 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  51.63 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  54.29 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  56.8 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  43.79 
 
 		 166 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  38.36 
 
 		 178 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  35.53 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  32.17 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  34.33 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  37.31 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  32.41 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  34.29 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  32.19 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  30.66 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  32.64 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  32.86 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  32.62 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  27.94 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  27.94 
 
 		 143 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  32.09 
 
 		 146 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  29.79 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  30.14 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  32.35 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.35 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  31.85 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  28.38 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 		 157 aa  45.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.52 
 
 		 155 aa  45.1  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  29.61 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  32.06 
 
 		 171 aa  41.6  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  27.75 
 
 		 157 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>