36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3854 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  100 
 
 		 156 aa  309  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  66.67 
 
 		 151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  65.31 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  57.64 
 
 		 147 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  57.55 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  53.85 
 
 		 180 aa  148  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  43.92 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  36.81 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  37.67 
 
 		 163 aa  90.5  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  34.84 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  36.36 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  38.33 
 
 		 178 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  39.05 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  32.86 
 
 		 173 aa  51.2  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  32.58 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.29 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  29.93 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  29.2 
 
 		 169 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  28.06 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  29.32 
 
 		 271 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  33.57 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  32.81 
 
 		 169 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  29.5 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  27.4 
 
 		 140 aa  43.5  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  28.99 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  32.46 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 		 164 aa  42  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  24.52 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  30.52 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  30.95 
 
 		 147 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  29.63 
 
 		 180 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  26.67 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  28.68 
 
 		 172 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01030  hydrogenase 3 maturation protease  29.41 
 
 		 172 aa  40.4  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>