22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0532 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  333  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  63.95 
 
 		 151 aa  200  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  67.19 
 
 		 156 aa  176  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  52.74 
 
 		 180 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  49.32 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  51.09 
 
 		 181 aa  131  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  44.88 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  34.53 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  34.06 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  38.84 
 
 		 178 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  31.65 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  33.81 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  29.25 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  32.84 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  26.35 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  32.26 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.06 
 
 		 155 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  31.45 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  31.16 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.84 
 
 		 188 aa  41.2  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>