55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0079 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  100 
 
 
140 aa  284  4e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
143 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  33.09 
 
 
143 aa  84.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  30.07 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  31.94 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  35 
 
 
163 aa  78.2  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  28.67 
 
 
146 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  34.81 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.97 
 
 
155 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2717  hypothetical protein  31.76 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  28.67 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  29.41 
 
 
168 aa  70.5  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  29.37 
 
 
158 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  28.67 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  30.56 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  29.66 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  27.86 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  34.29 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  29.71 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  26.56 
 
 
173 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  29.29 
 
 
147 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  27.97 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  25.87 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 
151 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.03 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  25 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0715  hydrogenase maturation protease superfamily  28.89 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0859564  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  30 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0269  hydrogenase expression/formation protein  27.01 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0820491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.16 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  25 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  28.29 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  26.8 
 
 
167 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2475  hydrogenase maturation protease  28.69 
 
 
167 aa  46.2  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  27.39 
 
 
181 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  23.02 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  26.35 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00344  hydrogenase 2 maturation protease  24.46 
 
 
184 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  24.83 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0455702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1876  hydrogenase maturation protease  27.21 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252899  normal  0.719205 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1924  hydrogenase maturation protease  26.42 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  25.17 
 
 
165 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1380  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.38 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0298181  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  24.82 
 
 
171 aa  42  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1639  hydrogenase maturation protease superfamily  28.99 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00363597  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0715  Ni/Fe hydrogenase, expression/formation protein  28.21 
 
 
177 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.930335  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0123  hypothetical protein  26.43 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1870  hydrogenase maturation protease  27.97 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0864  hydrogenase maturation protease HydD  26.14 
 
 
181 aa  41.2  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  24.46 
 
 
176 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  20.13 
 
 
191 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1014  hydrogenase maturation protease  24.34 
 
 
158 aa  40.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00768049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>