29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1458 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  63.95 
 
 		 164 aa  200  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  66.67 
 
 		 156 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  55.63 
 
 		 180 aa  155  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  56.85 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  52.32 
 
 		 181 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  44.29 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  35.37 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  34.53 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  36.03 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  30.34 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  35.51 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1369  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4493  hydrogenase maturation protease  29.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  31.97 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  31.47 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  28.86 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4665  hypothetical protein  28.03 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  32.65 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  29.71 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  29.73 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  29.5 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.84 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0013  hydrogenase maturation protease  23.45 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0011  hydrogenase maturation protease  23.45 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4247  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2862  hypothetical protein  27.7 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.159612  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5168  hydrogenase maturation protease  31.11 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.663728  normal  0.234349 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>