20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1526 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1526  HoxW protein  100 
 
 
168 aa  349  8.999999999999999e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000960813  hitchhiker  0.00380568 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4112  HoxW protein  70.95 
 
 
178 aa  224  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0111777  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  38.03 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  33.8 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  35.97 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0079  hydrogenase maturation protease  29.41 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.882887  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0113  HoxW protein  32.17 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.486904  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0532  hypothetical protein  31.65 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1458  hydrogenase maturation protease  36.03 
 
 
151 aa  63.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0983  HoxW protein  28.47 
 
 
166 aa  62.4  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1214  HoxW protein  26.35 
 
 
178 aa  60.8  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  38.71 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2794  hypothetical protein  25.58 
 
 
147 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3538  hypothetical protein  23.26 
 
 
152 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2554  hypothetical protein  24.82 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.165189  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  22.29 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  24.43 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2717  hypothetical protein  26.09 
 
 
151 aa  42  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2949  hydrogenase maturation protease  23.42 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3043  hydrogenase maturation protease  23.42 
 
 
146 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000605484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>