72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0508 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 180 aa  357  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04410  soluble hydrogenase processing peptidase, HoxW  52.35 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1139  hydrogenase maturation protease  38.96 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4495  peptidase M52, hydrogen uptake protein  38.76 
 
 		 177 aa  92  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4827  hydrogenase maturation protease  35.44 
 
 		 166 aa  91.7  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3415  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.18 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.100638  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3478  hydrogenase maturation protease  36.18 
 
 		 166 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.0224154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1857  hydrogenase maturation protease  36.84 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1020  hydrogenase maturation protease  35.21 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00482421 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2591  hydrogenase maturation protease  41.41 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2659  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3426  hydrogenase maturation protease  38.52 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.141018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3432  hydrogenase maturation protease  31.93 
 
 		 191 aa  62  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3367  hydrogenase maturation protease  28.39 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.239776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  30.26 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2951  hydrogenase expression/formation protein  31.13 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3201  hydrogenase maturation protease  32.81 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  31.34 
 
 		 271 aa  57.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  27.27 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2103  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0938724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0853  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0705  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.862619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  26.53 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03840  hydrogenase maturation protease  29.1 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3281  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2879  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.980378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.53 
 
 		 172 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1556  hydrogenase maturation protease  33.58 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  30.34 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3947  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.92 
 
 		 153 aa  51.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974859  normal  0.0407707 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  29.05 
 
 		 160 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3323  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.7 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2386  hypothetical protein  27.92 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0333  hydrogenase maturation protease  22.7 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.835463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0326  hydrogenase maturation protease  22.7 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1819  hydrogenase maturation protease  26.71 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1555  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.99 
 
 		 155 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.0326576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1675  HoxW protein  28.86 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.111038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.28 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2531  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  47.8  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2733  hydrogenase maturation protease  27.89 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  27.39 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  31.39 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1054  hydrogenase maturation protease  30.66 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.402831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.57 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.22 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0936  hydrogenase maturation protease  30.66 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  29.22 
 
 		 218 aa  45.8  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  27.52 
 
 		 257 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0975  hydrogenase maturation protease  26.9 
 
 		 167 aa  45.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0660111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0148  hydrogenase maturation protease  21.62 
 
 		 161 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0858  hydrogenase maturation protease  26.11 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4092  peptidase M52, hydrogen uptake protein  25.34 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0783921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  27.1 
 
 		 176 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  35.06 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  34.18 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  29.81 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1844  hydrogenase expression/formation protein  28.81 
 
 		 161 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2257  hydrogenase maturation protease  28.66 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  27.85 
 
 		 160 aa  42  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  29.14 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3885  hydrogenase maturation protease  26.28 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.445128  normal  0.911983 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 182 aa  41.2  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2409  hydrogenase maturation protease  40 
 
 		 169 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3854  HoxW protein  29.63 
 
 		 156 aa  41.2  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1347  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 153 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3760  hydrogenase maturation protease  31.03 
 
 		 158 aa  40.8  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3970  HybD peptidase  23.87 
 
 		 159 aa  40.8  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>