52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0589 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 182 aa  370  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2131  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.829671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0408  hydrogenase maturation protease  25.99 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.711224  normal  0.0552649 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  31.47 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  29.11 
 
 		 160 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  31.21 
 
 		 164 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  28.95 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1297  hydrogenase maturation protease  28.19 
 
 		 170 aa  50.1  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.864934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0477  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.07 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  29.88 
 
 		 167 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0196  hydrogenase maturation protease  24.29 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0455702 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  24.72 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0505  hydrogenase maturation protease  28.47 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  26.97 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0510  hydrogenase maturation protease  28.47 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1579  hydrogenase maturation protease  24.03 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3406  hydrogenase maturation protease  33.78 
 
 		 191 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  36.27 
 
 		 186 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  26.95 
 
 		 152 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  35.71 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  25.43 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  27.74 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  26.8 
 
 		 150 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 		 167 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  29.91 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  24 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  38.37 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  22.98 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  36.71 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  37.21 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2251  hydrogenase maturation protease  38.33 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012018  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  32.93 
 
 		 159 aa  41.6  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1414  hydrogenase expression/formation protein  30.61 
 
 		 166 aa  41.6  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  28.06 
 
 		 169 aa  41.6  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0508  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 180 aa  41.2  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2747  hydrogenase maturation protease  23.35 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2322  hydrogenase expression/formation protein  29.25 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.659738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>