106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0616 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  100 
 
 		 167 aa  340  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  89.22 
 
 		 167 aa  303  7e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  86.23 
 
 		 167 aa  290  4e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  39.87 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  39.58 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  33.78 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  32.68 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  34.44 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  30.52 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  30.41 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  30.25 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1136  hypothetical protein  28.75 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.999866 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.83 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  31.82 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.32 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.15 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.45 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  29.11 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  25.83 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  26.49 
 
 		 174 aa  52.4  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3329  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  31.82 
 
 		 172 aa  52  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.19 
 
 		 154 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  33.63 
 
 		 271 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  29.05 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  38.96 
 
 		 195 aa  50.8  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  38.96 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  38.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  38.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  38.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  38.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  30.57 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  38.96 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  28.38 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  26.75 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  29.94 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  30.71 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  27.39 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3190  hydrogenase 3 maturation protease  28.03 
 
 		 151 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  37.66 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  38.96 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  30.41 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  35.71 
 
 		 195 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  27.33 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  26.28 
 
 		 156 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  27.03 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  29.68 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  36.36 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  36.36 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  34.34 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0598  hydrogenase maturation protease  28.57 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2176  hydrogenase expression/formation protein  30.07 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0123485  normal  0.201269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  36.36 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  36.36 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  25.64 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  36.36 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0162  hydrogenase expression/formation protein  30.4 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  30.91 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2367  hydrogenase maturation protease  38.03 
 
 		 257 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0307441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 		 187 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  25.64 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  25.64 
 
 		 156 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02869  predicted maturation element for hydrogenase 2  27.97 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3462  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.97 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3420  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.97 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4305  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.97 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  30.95 
 
 		 207 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02818  hypothetical protein  27.97 
 
 		 164 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0703  hydrogenase expression/formation protein  27.97 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4241  peptidase M52, hydrogen uptake protein  24.84 
 
 		 182 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3173  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.97 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0700  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.97 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3279  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.97 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1037  hydrogenase expression/formation protein  47.62 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0456714  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  30.91 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3393  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.27 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.441153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3494  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.27 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.627392  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  30.77 
 
 		 160 aa  44.3  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0589  hydrogenase maturation protease  30.43 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3399  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.27 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3032  hydrogenase 3 maturation protease  25 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228313  hitchhiker  0.0000962819 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3328  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.27 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.581349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3319  hydrogenase 2 maturation endopeptidase  27.27 
 
 		 164 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00237916  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1075  peptidase M52, hydrogen uptake protein  39.47 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2502  HybD peptidase  34.83 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2796  hydrogenase maturation protease  29.3 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  33.72 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1127  hydrogenase maturation protease  26.83 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  32.32 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  29.37 
 
 		 160 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0522  hydrogenase maturation protease  38.16 
 
 		 177 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3521  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>