174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2331 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2331  peptidase M52, hydrogenase maturation peptidase  100 
 
 		 183 aa  369  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2175  hydrogenase maturation protease  70 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0085  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  65.68 
 
 		 181 aa  231  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0501687  normal  0.0549727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0451  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  62.66 
 
 		 159 aa  207  5e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0478  hydrogenase maturation protease  47.22 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0014  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  49.68 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0195  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.13 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1290  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  40.13 
 
 		 174 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.673562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0693  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  38.85 
 
 		 171 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.845339  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0628  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  38.85 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.836359 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1044  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  36.59 
 
 		 182 aa  108  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0777  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  39.61 
 
 		 158 aa  108  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.470969  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  44.08 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1336  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.58 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.291091  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0256  coenzyme F420-reducing hydrogenase, delta subunit  42.58 
 
 		 160 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0582  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  42.86 
 
 		 159 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.724194  normal  0.0407733 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0648  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  38.61 
 
 		 166 aa  98.6  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2220  hydrogenase maturation protease  33.95 
 
 		 170 aa  88.2  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.861671  normal  0.717829 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0074  coenzyme F420-reducing hydrogenase delta subunit  39.62 
 
 		 166 aa  85.9  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4597  hydrogenase maturation protease  34.84 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3530  hydrogenase maturation protease  35.4 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3819  hydrogenase maturation protease  32 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.0594228 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_554  hydrogenase maturation protease  32.89 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0589  hydrogenase maturation protease  30.92 
 
 		 167 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00428951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0272  hydrogenase maturation protease  32.67 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.268401 
 
 
-
 
NC_002936  DET0616  hydrogenase maturation protease  30.41 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1211  hydrogenase 1 maturation protease  29.93 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1090  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  60.8  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2142  hydrogenase 1 maturation protease  29.93 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.152456  normal  0.47053 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3101  hydrogenase expression/formation protein  31.61 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00978  HyaD  29.93 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.106803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00985  hypothetical protein  29.93 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2669  hydrogenase expression/formation protein  29.93 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.112067  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1157  hydrogenase expression/formation protein  31.97 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.486513  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1233  hydrogenase maturation protease  31.33 
 
 		 172 aa  60.1  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.120838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1999  hydrogenase maturation  32.28 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.116789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1276  hydrogenase 3 maturation protease  30.87 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1083  hydrogenase 1 maturation protease  29.93 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2621  hydrogenase 1 maturation protease  29.93 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00823631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1153  hydrogenase expression/formation protein  30.49 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.838065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08060  hydrogenase maturation protease  26.54 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1293  HyaD peptidase  30 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000175592  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3372  hypothetical protein  27.85 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.288217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1345  hydrogenase 1 maturation protease  28.67 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2125  hydrogenase maturation protease  30.72 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.295921  normal  0.0277446 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2717  hydrogenase 3 maturation protease  30.14 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.391136  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2340  hydrogenase 1 maturation protease  28.3 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.732485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1931  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1927  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1529  hydrogenase 1 maturation protease  29.1 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  0.329104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1987  hydrogenase 1 maturation protease  30.23 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2136  peptidase M52, hydrogen uptake protein  28.68 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0499  HyaD peptidase  29.07 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2150  hydrogenase expression/formation protein  29.07 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.133093  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2487  hydrogenase maturation protease  28.66 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1247  hydrogenase maturation protease  26.49 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.188771 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2053  hydrogenase maturation protease  30.2 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2740  hydrogenase maturation protease  28.48 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1707  hydrogenase expression/formation protein  32.54 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2606  hydrogenase maturation protease  31.97 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0209681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2546  hydrogenase maturation protease  32.93 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316612  normal  0.0941351 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_119  Ni/Fe hydrogenase maturation protease  28.21 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7262  hydrogenase expression/formation protein  38.37 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2822  Ni-Fe hydrogenase maturation factor-like protein  29.77 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1940  peptidase M52, hydrogen uptake protein  26.95 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2012  hydrogenase maturation protease  28.66 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0472  hydrogenase maturation protease  35.24 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.196333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1648  hydrogenase expression/formation protein  31.75 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0267  hydrogenase expression/formation protein  30.19 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.312911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0259  hydrogenase maturation protease  30.13 
 
 		 160 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0380  hydrogenase maturation protease  29.66 
 
 		 176 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1800  hydrogenase expression/formation protein  31.75 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1640  hydrogenase expression/formation protein  31.75 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0834  hydrogenase maturation protease  34.57 
 
 		 177 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.850937  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2139  hydrogenase expression/formation protein  26.25 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3769  hydrogenase expression/formation protein  32.26 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1635  hydrogenase expression/formation protein  31.75 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1971  hydrogenase expression/formation protein  29.01 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.814536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3804  hydrogenase maturation protease  33.33 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0322  peptidase M52, hydrogen uptake protein  27.27 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1165  hydrogenase expression/formation protein  31.15 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.464172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3225  hydrogenase maturation protease  29.7 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.679402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0542  hydrogenase expression/formation protein  36.47 
 
 		 169 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.995345  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2966  hydrogenase 3 maturation protease  28.97 
 
 		 156 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0109  hydrogenase maturation protease  29.53 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3048  hydrogenase 3 maturation protease  30.2 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.171447 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0765  hydrogenase expression/formation protein  28.05 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3155  hydrogenase 3 maturation protease  30.2 
 
 		 156 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.120666 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  30.99 
 
 		 1053 aa  51.2  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3005  hydrogenase 3 maturation protease  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2997  hydrogenase 3 maturation protease  28.97 
 
 		 156 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02567  protease involved in processing C-terminal end of HycE  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0972  hydrogenase maturation protease HycI  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3968  hydrogenase 3 maturation protease  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3159  hydrogenase 3 maturation protease  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02532  hypothetical protein  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50560  hydrogenase expression/formation protein, HoxM  34.44 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00480221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2853  hydrogenase 3 maturation protease  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0995  hydrogenase 3 maturation protease  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2842  hydrogenase 3 maturation protease  29.45 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0786118 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>